在遥远的日本乡村，一个充满自然美景的小岛上，生活着一位天真烂漫的小女孩波妞。她有着一头鲜艳的红色短发和一双明亮的大眼睛，总是充满好奇地探索着周围的世界。某一天，在海边玩耍时，波妞发现了一只被困在玻璃瓶中的小金鱼。这只小金鱼不仅拥有着耀眼的金色鳞片，还散发着一种神秘而温暖的气息。

出于本能的善良与同情心，波妞将小金鱼从瓶中解救出来，并给它取名为“波妞”。然而，这个看似普通的行为却引发了一系列意想不到的奇妙事件。原来，这并不是一只普通的金鱼，而是一位被施了魔法的海洋公主——宗像莉莎。由于某种原因，她被迫化身为金鱼形态，被困在人类世界中寻求帮助。

随着故事的发展，波妞与宗像莉莎之间建立了深厚的友谊。尽管她们来自完全不同的世界，但彼此间的纯真与真诚让这段友情愈发珍贵。波妞的父亲宗像五郎是一名渔夫，他对女儿的善良行为表示支持，并鼓励她继续勇敢地面对未知的挑战。

与此同时，宗像莉莎也逐渐恢复了自己的记忆，并意识到自己肩负着重大的使命。为了拯救她的王国以及所有生活在大海中的生物，她必须克服内心的恐惧与犹豫，重新找回属于自己的力量。在这个过程中，波妞成为了她最坚强的支持者，两人的羁绊也因此更加紧密。

《悬崖上的金鱼姬》以其温馨感人的故事情节、细腻唯美的画面风格以及深刻的主题内涵赢得了观众们的喜爱。影片通过讲述人与自然之间的和谐共处，传递出对生命价值的尊重与珍视。它不仅仅是一部关于成长与冒险的作品，更是一首献给童年梦想与纯粹情感的赞歌。